Auch in „The Quintessential Quintuplets 2“, der zweiten Staffel der Anime-Adaption von Negi Harubas gleichnamiger Manga-Reihe, hat es Fuutaro Uesugi nach wie vor nicht leicht: Nicht nur, dass er nach dem Skiausflug mit der Schule gleich im Krankenhaus landet; auch seine Mission, den fünf „Hohlbirnen“ bei ihren schulischen Schwächen zu helfen, ist noch lange nicht erfüllt. Es stehen nämlich die nächsten Prüfungen an und die Lernbereitschaft der Fünflinge hält sich trotz der knappen Zeit nach wie vor in Grenzen.Yotsuba beschäftigt sich lieber mit den Sportclubs der Schule, Ichika denkt gar daran die Schule hinzuschmeißen, um sich auf ihre Schauspielkarriere zu konzentrieren, Nino und Miku geraten immer öfter aneinander und nur Itsuki versucht, sich mit der Situation zu arrangieren; vor allem deswegen, weil sie von Fuutaros ärmlichen Familienverhältnissen weiß und an das Wohl seiner jüngeren Schwester denkt.Und genau jetzt beginnt Fuutaro sich wieder an ein Erlebnis aus der Vergangenheit zu erinnern: Bei einem Schulausflug nach Kyoto vor fünf Jahren ist ihm ein äußerst liebenswertes, rothaariges Mädchen begegnet, das der Auslöser für seinen Lebenswandel vom Unruhestifter zum Vorzeigeschüler war. Leider können weder er, noch eine der Fünflinge sich an die Details erinnern, zumal er nach wie vor Probleme hat, die fünf Schwestern auseinanderzuhalten. Könnte eine von ihnen das Mädchen aus dieser schicksalhaften Begegnung sein?